Владыка получил от патриарха новое назначение  - возглавить Духовную академию в Москве.

15 июля архиепископ Амвросий после Божественной литургии в академическом храме святого апостола и евангелиста Иоанна Богослова обратился к студентам и преподавателям с прощальным словом. «Хочу сердечно поблагодарить всех вас за вашу любовь, за все труды, которые вы совершали, за ваше поразительное доброе отношение ко мне. Вчера я получал массу писем и сообщений. Они одновременно и радовали, и отзывались болью в моем сердце», - сказал недавний ректор. Он пожелал всем радости во Христе, напомнив, что радость и утешение человек может найти только в молитве и только в Боге.

«Бывало и такое, что все мы с вами иногда ссорились, не понимали друг друга, спорили. Но все это человеческое. Самое главное – это то послевкусие, которое остается сейчас. Это послевкусие любви, единства, дружбы и соработничества на ниве Христовой. Где бы я не находился, обещаю молиться за всех вас. Спасибо вам всем!», сказал архиепископ.