Три переодетых в жандармских офицеров террориста из партии эсеров-максималистов проникли на дачу Столыпина на Аптекарском острове и бросили себе под ноги портфели с взрывчаткой. Среди убитых были все трое боевиков, князь Иван Накшидзе, генерал-майор Александр Замятин, член Совета министра внутренних дел, сенатор, действительный статский советник Сергей Хвостов, крестьяне, мещане, женщины и даже пятилетний ребенок. Сам Столыпин во время этого покушения не пострадал, но двое его детей были ранены.
Вторая попытка была сделана 3 января 1907 года. В этот день Столыпин должен был присутствовать с петербургским градоначальником фон дер Лауницем на освящении нового медицинского института. Однако охранному отделению стало известно о готовящемся покушении, и Петра Аркадьевича с трудом уговорили не ходить на богослужение. В итоге эсер Евгений Кудрявцев по кличке «Адмирал», собиравшийся убить Столыпина и фон дер Лауница, застрелил только градоначальника.