«Систематическое обучение врачебному искусству при госпиталях» происходило с 1733 года, но в декабре 1735 года вышел первый документ, регулирующий медицинское образование: «Генеральный регламент о госпиталях и о должностях определенных при них докторов и прочих медицинского чина слушателей». В школах преподавали анатомию и хирургию (преподаватели этих дисциплин назывались операторами), учили рисованию и латинскому языку. Для успешного обучения требовался хороший анатомический театр и достаточное количество трупов для препарирования. Руководил процессом обучения госпитальный доктор. Регламент предписывал «способным в науках докторам» переводить иностранные книги по анатомии и хирургии на русский язык и писать отечественные учебники.
Впервые в России лекции по анатомии и хирургии на русском языке начал читать в 1764 году хирург, анатом, ботаник и лекарствовед Константин Щепин в госпитальной школе при Петербургском сухопутном госпитале.
Школы просуществовали до организации в 1786 году медико-хирургических училищ.